«Атлетик Эскальдес», основанный в 2002 году, делит город Эскальдес-Энгордань — а вместе с ним и местное соперничество — с другим клубом, носящим почти идентичное название, «Интер Эскальдес». Выйдя в Примера Дивисьо в 2004 году и вылетев из неё уже через три сезона, клуб провёл двенадцать сезонов во втором дивизионе, прежде чем окончательно вернуться в элиту в 2019 году.
Это возвращение положило начало стремительному прогрессу: в 2022 году клуб завоевал свой первый трофей — Кубок Конституции, а год спустя, в сезоне 2022/23, сенсационно выиграл свой пока единственный чемпионский титул Андорры. Это достижение открыло дорогу к по-настоящему историческому моменту — дебюту в квалификации Лиги чемпионов в 2023 году, где клуб встретился с черногорским «Будучностью» из Подгорицы в формате мини-турнира, прошедшего в Исландии, и уступил 0:3.
В 2025 году «Атлетик» наконец взял верх над своим извечным местным соперником, обыграв «Интер Эскальдес» 5:3 в финале Суперкубка Андорры — свой первый трофей в этом турнире после двух предыдущих поражений в финалах. Домашние матчи команда проводит на стадионе «Эстади Комунал» в Андорра-ла-Велья.