FC Dnipro fue uno de los clubes más importantes de la historia del fútbol ucraniano y sus orígenes se remontan a 1918. El club fue fundado en Ekaterinoslav en la escuela técnica BRIT y durante sus primeras décadas cambió varias veces de denominación. Entre sus nombres históricos estuvieron Petrovets, Stal y Metalurh, antes de adoptar el nombre Dnipro a comienzos de los años 60. Su historia estuvo estrechamente relacionada con el carácter industrial de la ciudad y con el complejo industrial Yuzhmash, que apoyó al equipo durante muchos años. Sus colores tradicionales fueron el blanco, el azul y el celeste.
La etapa más exitosa de Dnipro llegó en los años 80, cuando el club se convirtió en uno de los principales equipos de la Unión Soviética. Conquistó el campeonato soviético por primera vez en 1983 y repitió el éxito cinco años después. El primer título tuvo un significado especial, ya que se aseguró tras una victoria por 4-2 sobre el Spartak de Moscú en la última jornada. Bajo la dirección de Volodymyr Yemets, Dnipro conquistó su primer campeonato nacional y posteriormente permaneció entre los mejores equipos soviéticos.
El segundo campeonato soviético llegó en 1988 bajo las órdenes de Yevhen Kucherevskyi. Un año después, Dnipro ganó también la Copa de la URSS, derrotando al Torpedo de Moscú por 1-0 en la final. El club ya había ganado la Copa de la Federación de Fútbol de la URSS en 1986 y 1989, convirtiéndose en el único equipo que conquistó esa competición en dos ocasiones. Entre los principales jugadores de aquella generación estuvieron Hennadiy Lytovchenko, Oleh Protasov, Volodymyr Liutyi y Oleksii Cherednyk, todos ellos figuras destacadas del fútbol soviético.
Los éxitos de los años 80 también tuvieron reflejo en Europa. Dnipro alcanzó dos veces los cuartos de final de la Copa de Europa, en las temporadas 1984/85 y 1989/90. En la primera campaña ganó tres de sus seis partidos antes de ser eliminado por el Girondins de Burdeos. Cuatro años después, el Benfica puso fin a su recorrido en la misma ronda. Estas campañas fueron algunos de los principales logros europeos del club antes de la desaparición de la Unión Soviética.
Tras la independencia de Ucrania, Dnipro continuó siendo uno de los principales equipos del país. Terminó dos veces como subcampeón de Ucrania, en 1993 y 2014, pero nunca ganó el campeonato nacional. También alcanzó tres finales de la Copa de Ucrania. En 1995 perdió ante el Shakhtar Donetsk en los penaltis después de un empate 1-1; en 1997 volvió a caer ante el Shakhtar, esta vez por 1-0; y en 2004 perdió 0-2 frente al Dynamo de Kiev.
El mayor éxito de toda la historia del club llegó en Europa durante la temporada 2014/15. Dnipro comenzó aquella campaña en la fase de clasificación de la Liga de Campeones, pero pasó a la Liga Europa después de perder ante el FC København. En su camino hacia la final eliminó al Olympiacos, al Ajax y al Club Brugge, mientras que en semifinales superó al Napoli después de empatar 1-1 en Italia y ganar 1-0 en Kiev. Fue la primera final europea de la historia del club.
La final de la Liga Europa se disputó el 27 de mayo de 2015 en el Estadio Nacional de Varsovia. Dnipro se adelantó gracias a Nikola Kalinić, pero el Sevilla remontó. Los goles de Grzegorz Krychowiak y dos de Carlos Bacca dieron la victoria por 3-2 al conjunto español. Ruslan Rotan marcó el segundo gol del equipo ucraniano. A pesar de la derrota, alcanzar la final sigue siendo el mayor logro europeo de la historia de Dnipro.
Entre los principales protagonistas de aquel equipo estuvieron Ruslan Rotan, Yevhen Konoplyanka, Yevhen Seleznyov, Nikola Kalinić y el portero Denys Boyko. El entrenador Myron Markevych también desempeñó un papel fundamental en el camino hacia la final. Según los registros de la UEFA, Rotan disputó más partidos de Liga Europa con el club que cualquier otro jugador, mientras que Seleznyov es su máximo goleador en esta competición.
Los últimos años de Dnipro estuvieron marcados por graves problemas económicos. En 2016, la UEFA excluyó al club de futuras competiciones europeas por incumplimientos de las normas de juego limpio financiero. El equipo fue descendiendo progresivamente en la estructura del fútbol ucraniano y disputó su última temporada en la Liga Amateur de Ucrania en 2018/19. El histórico club desapareció en 2019.
El último estadio del Dnipro fue el Dnipro-Arena, inaugurado en 2008 sobre el antiguo emplazamiento del estadio Metalurh. El moderno recinto tiene capacidad para más de 31.000 espectadores y fue la casa del club hasta su desaparición. Antes de trasladarse allí, Dnipro también disputó sus partidos en el estadio Meteor. Durante la campaña europea 2014/15, sin embargo, sus partidos como local tuvieron que jugarse en Kiev por motivos de seguridad.
La historia de Dnipro combina así dos épocas muy diferentes: una edad de oro en el fútbol soviético, coronada por dos campeonatos de la URSS y una Copa de la URSS, y la extraordinaria campaña que llevó al club hasta la final de la Liga Europa en 2015. Nunca ganó el campeonato de Ucrania ni la Copa de Ucrania, pero durante décadas fue una de las instituciones más importantes del fútbol del país. Su legado está vinculado tanto a los equipos de Volodymyr Yemets y Yevhen Kucherevskyi como a la posterior generación encabezada por Yevhen Konoplyanka, Ruslan Rotan y Yevhen Seleznyov. La desaparición del club en 2019 puso fin a su actividad, pero sus logros siguen formando parte de la historia del fútbol ucraniano.