Эльбасани «АФ Эльбасани» — один из самых молодых клубов албанского футбола, однако его история тесно связана с давними футбольными традициями города Эльбасан. Нынешний клуб был основан в 2021 году на фоне финансовых и организационных проблем, связанных с прежним «КФ Эльбасани». Эти команды не следует полностью отождествлять в историческом плане. Футбольные традиции Эльбасана значительно старше: исторический «КФ Эльбасани» ведёт свою историю с 1923 года и дважды становился чемпионом Албании — в сезонах 1983/84 и 2005/06. Современный «АФ Эльбасани» продолжает футбольную традицию города, но является отдельным клубом, основанным уже в XXI веке.
Новая команда сразу начала стремительный подъём по футбольной пирамиде. В сезоне 2021/22 «АФ Эльбасани» выиграл Катарегорию е Третэ — четвёртый уровень албанского футбола — и добился повышения уже в первом сезоне. В следующем чемпионате команда стала первой в группе B Катарегории е Дытэ. При этом «Эльбасани» не потерпел ни одного поражения, одержав 18 побед и сыграв четыре матча вничью. В финале за общий титул дивизиона команда встретилась с «Ворой», но уступила со счётом 1:2. Поэтому корректнее говорить о победе «АФ Эльбасани» в группе B, а не о чемпионстве во всей Катарегории е Дытэ.
Главный успех первых лет пришёлся на сезон 2023/24. «АФ Эльбасани» выиграл Катарегорию е Парэ и впервые в своей истории вышел в высший дивизион Албании. Чемпионство было обеспечено ещё до последнего тура, а завершение сезона стало настоящим праздником на домашнем стадионе. В последнем матче команда победила «Бюлис» со счётом 3:2 на Elbasan Arena и получила чемпионский трофей. Таким образом, всего за три сезона клуб прошёл путь от четвёртого уровня до элитного дивизиона.
В дебютном сезоне в Катарегории Супериоре «АФ Эльбасани» выступил достаточно уверенно. В чемпионате 2024/25 команда заняла пятое место, набрав 50 очков в 36 матчах. На её счету было 11 побед, 17 ничьих и восемь поражений. В итоге «Эльбасани» остановился непосредственно за первой четвёркой чемпионата.
Традиционные цвета клуба — жёлтый и синий. Домашние матчи проходят на Elbasan Arena, одном из наиболее известных футбольных стадионов Албании и важном месте для футбольной истории города. Именно здесь команда праздновала чемпионство Катарегории е Парэ в 2024 году.
Европейский дебют «АФ Эльбасани» состоялся в 2026 году. В первом квалификационном раунде Лиги конференций УЕФА албанский клуб встретился с БАТЭ. Первый матч в Эльбасане завершился со счётом 1:1, а ответная встреча в Сумгаите не принесла голов даже после дополнительного времени. В серии пенальти белорусская команда победила со счётом 5:4. «АФ Эльбасани» не смог пройти дальше, однако противостояние стало первым выступлением клуба в еврокубках и важным событием в его современной истории.
Одной из наиболее заметных фигур современного «АФ Эльбасани» является Иван Гвозденович, руководивший командой во время европейской кампании 2026 года. История клуба намного короче футбольной истории самого Эльбасана, но темпы его развития впечатляют: от четвёртого дивизиона в 2021 году до высшей лиги всего за три сезона, а затем и до дебюта в еврокубках в 2026 году.