«Дукаджини» Клина — один из клубов, связанных с развитием организованного футбола на западе Косова. Команда была основана в 1958 году и на протяжении значительной части своей ранней истории выступала в региональных и провинциальных соревнованиях в рамках югославской футбольной системы. Название клуба связано с Лекой Дукаджини, средневековым албанским феодалом, чьё имя тесно связано с историей региона.
Главный успех «Дукаджини» на раннем этапе истории пришёлся на сезон 1993/94, когда клуб выиграл чемпионат Косова в соревнованиях, проводившихся вне официальной футбольной системы Югославии. В финале команда из Клины победила «Фламуртари» Приштина со счётом 1:0. Годом позже клуб также завоевал Суперкубок Косова, победив «Приштину» в серии пенальти. Эти достижения остаются важной частью истории клуба и косовского футбола периода до независимости.
После войны в Косове клубу пришлось заново строить своё положение в национальном футболе. В XXI веке «Дукаджини» постепенно вернулся в высший дивизион. В сезоне 2020/21 «Дукаджини» вышел в финал Кубка Косова, где уступил «Ллапи» в серии пенальти. Сам выход в финал стал одним из лучших результатов клуба в национальных соревнованиях того периода.
Переломный момент в современной истории команды наступил в 2023 году, когда «Дукаджини» дебютировал в еврокубках. Первым соперником в первом квалификационном раунде Лиги конференций УЕФА стал гибралтарский «Европа». В первом матче в Приштине косовская команда победила со счётом 2:1, а в ответной встрече на Гибралтаре выиграла 3:2. Общий счёт 5:3 позволил «Дукаджини» выйти во второй квалификационный раунд.
Следующим соперником стал «Риека». Хорватский клуб выиграл первый матч в Приштине со счётом 1:0, а в ответной встрече на стадионе «Руевица» победил 6:1. Для «Дукаджини» эта кампания всё равно стала исторической: клуб впервые сыграл в еврокубках и выиграл своё первое двухматчевое противостояние в турнирах УЕФА. Выход за счёт «Европы» остаётся одним из важнейших международных достижений в истории команды.
Важнейшей частью идентичности «Дукаджини» остаётся связь с местным сообществом. Клина — небольшой город на западе Косова, и клуб на протяжении десятилетий сохранял тесную связь с местными болельщиками. Домашние матчи команда проводит на стадионе «18 июня», являющемся её традиционной ареной. Для проведения европейских матчей стадион не соответствовал требованиям УЕФА, поэтому первые домашние встречи «Дукаджини» в еврокубках прошли на стадионе «Фадиль Вокрри» в Приштине.
Выступления «Дукаджини» в высшем дивизионе Косова и дебют на европейской арене стали очередными этапами истории, начавшейся в 1958 году. Клуб не относится к числу самых титулованных команд Косова, однако чемпионство 1994 года, Суперкубок страны и исторический выход во второй квалификационный раунд Лиги конференций подчёркивают его значение для футбольной истории западной части Косова.