El club nació de forma modesta en 1959 como Llansantffraid FC, representando al pequeño pueblo fronterizo de Llansantffraid-ym-Mechain, con una población de apenas un millar de habitantes. Durante sus primeras décadas, el equipo fue escalando en la pirámide del fútbol galés, ganando siete veces la liga regional Montgomeryshire Amateur Football League antes de lograr el ascenso a la máxima categoría del país en la temporada 1992-93.
El verdadero punto de inflexión llegó en 1996, cuando el equipo local firmó un acuerdo de patrocinio pionero con una empresa informática de la vecina Oswestry, Total Network Solutions, adoptando el nombre de Total Network Solutions Llansantffraid. Un año después, el club dio un paso más y renunció por completo a su nombre tradicional, pasando a ser conocido en toda Europa como Total Network Solutions FC -el primer club de las Islas Británicas en llevar únicamente el nombre de su patrocinador-. Aquel movimiento supuso un enorme impulso económico y deportivo: el TNS se convirtió en el primer equipo de Llansantffraid en clasificarse para competiciones europeas, y en los años siguientes se enfrentó, entre otros, al Manchester City (partido disputado en el Millennium Stadium de Cardiff, con capacidad para 72.000 espectadores) y, en la fase clasificatoria de la Liga de Campeones de la UEFA 2005-06, al vigente campeón, el Liverpool, cayendo por un global de 6-0, aunque el joven portero local, Gerard Doherty, recibió elogios incluso del entrenador del Liverpool.
En 2003 el club se fusionó con el equipo inglés Oswestry Town, lo que convirtió al TNS en el único club plenamente profesional del sistema de ligas galés. Sin embargo, la situación se complicó en 2006, cuando Total Network Solutions fue adquirida por el gigante de las telecomunicaciones British Telecom, poniendo fin al acuerdo de patrocinio. Dado que el acrónimo TNS, ya profundamente arraigado entre los aficionados y en la UEFA, se había convertido en una marca valiosa por sí misma, los dirigentes del club optaron por el nombre The New Saints -en referencia a los santos patronos de ambas localidades fusionadas, Santa Ffraid y San Oswaldo.
Desde el punto de vista de la historia y las estadísticas deportivas, todas estas transformaciones describen a una misma entidad jurídica: tanto la UEFA como la federación galesa consideran a The New Saints como el sucesor directo del Llansantffraid y del Total Network Solutions, atribuyendo todos los títulos conquistados al historial de un único club. Gracias a ello, los aficionados de hoy pueden mirar con orgullo unas estadísticas en las que 17 títulos de liga (a fecha de la temporada 2024-25) convierten a The New Saints en el club más laureado de la historia del fútbol galés. El equipo disputa sus partidos como local en Park Hall, en Oswestry, pese a representar oficialmente a un país al otro lado de la frontera.