KF Shkupi to piłkarski klub z dzielnicy Čair w Skopju, powstały w 2012 roku z fuzji dwóch klubów – FK Sloga Jugomagnat oraz niżej notowanego FC Albarsa. Choć Macedońska Federacja Piłkarska formalnie nie uznaje Shkupi za bezpośredniego następcę prawnego Slogi Jugomagnat i prowadzi osobną dokumentację obu klubów, kierownictwo Shkupi oraz jego kibice, zorganizowani w grupie Shvercerat (Przemytnicy) – tej samej, która wcześniej wspierała Slogę – za oficjalną datę powstania klubu uznają rok 1927, kontynuując tym samym tradycję piłkarską dzielnicy zamieszkanej głównie przez społeczność albańską, turecką i romską.
Historia Slogi Jugomagnat wpisuje się w szerszy proces politycznej emancypacji albańskiej mniejszości w Macedonii Północnej. W maju 1999 roku klub, którego trzon stanowili zawodnicy pochodzenia albańskiego, zdobył mistrzostwo Macedonii – po raz pierwszy od uzyskania przez kraj niepodległości tytuł ten trafił do drużyny z albańskim rdzeniem. W ekipie tej występowali m.in. napastnik Argjend Beqiri, jeden z nielicznych wówczas etnicznych Albańczyków powoływanych do reprezentacji Macedonii, oraz obrońca Zekirija Ramadani.
Po reaktywacji w 2012 roku klub rozpoczął rozgrywki od trzeciego poziomu ligowego, jednak w ciągu zaledwie trzech sezonów dwukrotnie awansował, docierając do Pierwszej Ligi Macedońskiej. Pierwszy historyczny sukces przyszedł w sezonie 2017/18, gdy Shkupi, zajmując czwarte miejsce w tabeli, po raz pierwszy w swojej nowożytnej historii zakwalifikował się do eliminacji Ligi Europy UEFA. Prawdziwie przełomowy moment nastąpił jednak w sezonie 2021/22, gdy drużyna prowadzona przez trenera Goce Sedloskiego zdobyła pierwsze w swojej nowoczesnej historii mistrzostwo Macedonii Północnej, zapewniając sobie tytuł jeszcze przed końcem rozgrywek. Sukces ten otworzył klubowi drogę do debiutu zarówno w eliminacjach Ligi Mistrzów UEFA, jak i Ligi Europy.
Drużyna, znana pod przydomkiem Pëllumbat (Gołębie), rozgrywa mecze domowe na stadionie Čair w rodzimej dzielnicy, a jej tradycyjnym rywalem w tzw. derbach etnicznych pozostaje macedoński klub FK Wardar Skopje. Po latach stabilnego rozwoju klub przeżywa jednak poważny kryzys organizacyjny, zapoczątkowany rezygnacją wieloletniego prezesa i głównego sponsora, tureckiego biznesmena Olguna Aydına, w listopadzie 2024 roku, co doprowadziło do znaczącego spadku wyników sportowych w kolejnych sezonach.