FC Hegelmann to przykład klubu, który w ciągu kilkunastu lat przeszedł drogę od amatorskiej drużyny pracowników firmy logistycznej do jednego z czołowych zespołów litewskiej piłki. Klub powstał w 2009 roku, z inicjatywy firmy Hegelmann Transporte, która chciała rozwijać aktywność sportową swoich pracowników. Początkowo zespół rywalizował w rozgrywkach niższych lig i przez kilka lat opierał się przede wszystkim na lokalnych zawodnikach.
Przełom nastąpił pod koniec poprzedniej dekady. W 2018 roku Hegelmann wygrał południową strefę II ligi, a rok później zadebiutował na drugim poziomie rozgrywkowym. W sezonie 2020 zajął drugie miejsce w I lidze, dzięki czemu wywalczył awans do litewskiej ekstraklasy. Debiutancki sezon w A lygo zespół zakończył na piątej pozycji.
W kolejnych latach klub zaczął odgrywać coraz większą rolę w krajowej rywalizacji. Hegelmann trzykrotnie docierał do finału Pucharu Litwy — w 2022, 2024 i 2025 roku — jednak żadnego z tych finałów nie wygrał. W 2024 i 2025 roku drużyna zdobyła natomiast srebrne medale mistrzostw Litwy. Tym samym klub z Kauno rajonas stał się jednym z najważniejszych zespołów walczących o najwyższe miejsca w A lygo, choć wciąż czeka na swoje pierwsze mistrzostwo kraju i pierwsze duże trofeum.
Rozwój sportowy doprowadził również do debiutu FC Hegelmann w europejskich pucharach. Pierwszy start nastąpił w kwalifikacjach Ligi Konferencji Europy w 2023 roku. Klub wracał do tych rozgrywek również w 2025 i 2026 roku, choć dotychczas nie zdołał przejść pierwszej rundy kwalifikacyjnej. Europejskie występy są jednak kolejnym etapem budowania pozycji zespołu, który jeszcze kilka lat wcześniej rywalizował na drugim poziomie litewskiego futbolu.
Domowe mecze Hegelmann rozgrywa na stadionie w Raudondvaris, w rejonie kowieńskim. Klub jest kojarzony z niebiesko-białymi barwami i rozwija również własne struktury młodzieżowe oraz drużyny rezerwowe. Jedną z ważniejszych postaci okresu szybkiego rozwoju zespołu był Andrius Skerla, który pracował w klubie od debiutu w A lygo w 2021 roku do końca sezonu 2025. Pod jego kierownictwem Hegelmann dwukrotnie zdobył ligowe srebro i trzy razy dotarł do finału Pucharu Litwy.