История ЧФР Клуж началась в 1907 году и тесно связана с железнодорожным наследием Клуж-Напоки. Клуб был основан как Kolozsvári Vasutas Sport Club, а связь с железнодорожниками сохранилась в названии CFR и традиционном прозвище «Железнодорожники». Традиционные цвета команды — бордовый и белый. Домашние матчи клуб проводит на стадионе «Доктор Константин Рэдулеску», названном в честь бывшего игрока, тренера и врача клуба.
На протяжении большей части XX века ЧФР Клуж не относился к числу ведущих клубов Румынии. Перелом произошёл уже в XXI веке, когда команда быстро поднялась в национальной футбольной иерархии. Ключевым стал сезон 2007/08: клуб впервые выиграл чемпионат Румынии и одновременно завоевал Кубок Румынии. С этого момента ЧФР Клуж превратился в одного из главных участников борьбы за титул. К 2025 году клуб завоевал восемь чемпионских титулов Румынии — в 2008, 2010, 2012 годах и пять раз подряд в период с 2018 по 2022 год. В его активе также пять Кубков Румынии, последний из которых был выигран в 2025 году, а также четыре Суперкубка Румынии.
Первый чемпионский титул открыл клубу дорогу к заметным выступлениям в Европе. В сезоне Лиги чемпионов 2008/09 ЧФР Клуж победил «Рому» со счётом 2:1 в Риме. Эта победа стала одним из самых ярких результатов румынского клуба на европейской арене. В том же групповом этапе команда сыграла дома 0:0 с «Челси». ЧФР вновь выступал в групповой стадии Лиги чемпионов в 2010 и 2012 годах. В сезоне 2012/13 румынский клуб добился ещё одного исторического результата, победив «Манчестер Юнайтед» со счётом 2:1 на «Олд Траффорд». ЧФР завершил групповой этап третьим и продолжил выступление в Лиге Европы.
Европейские успехи клуба продолжились и в следующем десятилетии. В сезоне Лиги Европы 2019/20 ЧФР Клуж дошёл до 1/16 финала, где встретился с «Севильей». Первый матч в Румынии завершился со счётом 1:1, а ответная встреча в Испании — 0:0. Клужский клуб выбыл по правилу выездного гола, которое в тот период ещё применялось в турнирах УЕФА. В сезоне 2020/21 команда вновь сыграла в групповой стадии Лиги Европы, подтвердив статус одного из наиболее стабильных представителей Румынии в еврокубках.
С современным подъёмом клуба связаны несколько важных фигур. Иулиу Мурешан занимал пост президента в период, когда ЧФР Клуж превратился в ведущую силу румынского футбола. Большое значение имел и Дан Петреску, который в качестве главного тренера привёл команду к нескольким чемпионским титулам. Среди футболистов одной из наиболее узнаваемых фигур современной истории клуба стал Чиприан Деак, на протяжении многих лет остававшийся важной частью команды.
Сегодня ЧФР Клуж является одним из самых успешных румынских клубов XXI века. Его историю определяют железнодорожные корни, характерные бордово-белые цвета, многочисленные национальные трофеи и памятные матчи против известных европейских соперников. Путь от команды железнодорожников до восьмикратного чемпиона Румынии стал одним из наиболее заметных примеров развития современного румынского клубного футбола.