Немногие румынские клубы настолько тесно связаны с университетской идентичностью своего города, как «Университатя Клуж». История команды начинается в 1919 году, когда спортивная организация румынского студенческого общества «Петру Майор» вместе с самой организацией переехала в Клуж. С первых лет существования клуб был связан с университетской средой, а его традиционные чёрно-белые цвета стали одним из главных элементов идентичности команды.
Главной страницей в истории «Университатя Клуж» остаётся Кубок Румынии. Клуб сыграл в финале уже первого розыгрыша турнира в 1934 году, а всего шесть раз доходил до решающего матча. Единственная победа была одержана в 1965 году. В финале на стадионе Республика в Бухаресте команда, выступавшая тогда под названием «Штинца Клуж», победила «Динамо Питешти» со счётом 2:1. Голы забили Ремус Кымпяну и Золтан Ивансукс, а в составе победителей также выступали такие игроки, как Михай Адам и Симион Могуц.
Победа 1965 года позволила «Университатя Клуж» впервые выйти на европейскую арену. В Кубке обладателей кубков сезона 1965/66 румынская команда в первом раунде дважды победила австрийский «Винер-Нойштадтер» — 1:0 в гостях и 2:0 дома. В следующем раунде соперником стал «Атлетико Мадрид». Испанский клуб выиграл оба матча: 2:0 в Клуже и 4:0 в Мадриде.
Второе участие клуба в еврокубках состоялось в Кубке УЕФА сезона 1972/73. «Университатя Клуж» начала турнир с убедительной победы над софийским «Левски» со счётом 4:1, однако болгарская команда сумела изменить ход противостояния в ответной встрече, выиграв 5:1 после дополнительного времени. В 1995 году клуб также выступал в Кубке Интертото, но занял последнее место в своей группе.
В национальном футболе «Университатя Клуж» не располагает таким количеством трофеев, как наиболее титулованные румынские клубы. Значение команды определяется прежде всего её многолетней традицией, связью с Клужем и историческими отношениями с университетской средой. Среди наиболее известных фигур в истории клуба — Михай Адам, Ремус Кымпяну и Мирча Лука. Последний стал одним из главных символов команды, а его память увековечена рядом со стадионом.
Сегодня «Университатя Клуж» проводит домашние матчи на стадионе Клуж-Арена, расположенном рядом с местом исторического стадиона «Ион Мойна». В 2025 году клуб вернулся в еврокубки после более чем пятидесятилетнего перерыва, получив право выступить в Лиге конференций УЕФА. Это стало важным событием для команды, чьё предыдущее участие в европейском турнире состоялось ещё в сезоне 1972/73.
История «Университатя Клуж» — это прежде всего история традиции, местной идентичности и тесной связи с университетской жизнью. Единственный Кубок Румынии не отражает полностью историческое значение клуба: команда сыграла в первом финале турнира в 1934 году и шесть раз доходила до решающего матча. Возвращение в европейский футбол после 53 лет также показало, что чёрно-белая традиция остаётся важной частью современного облика клуба.