El FC Pyunik Ereván es el club más laureado de la historia de la Armenia independiente, fundado por Khoren Hovhannisyan, considerado el mejor futbolista armenio del siglo XX. El club se fundó en 1992 como Homenetmen Ereván y conquistó el título en la primerísima temporada de la liga independiente, compartiéndolo -por igualdad de puntos- con el FC Shirak de Gyumri. El propio Hovhannisyan ejerció entonces como jugador y entrenador a la vez, marcando 17 goles en 27 partidos.
El punto de inflexión llegó en 1995, cuando cambios políticos obligaron a la organización Homenetmen a cambiar de nombre: el club adoptó entonces el de Pyunik, que significa "Fénix", el ave mítica que renace de sus propias cenizas. El simbolismo resultó profético: en la temporada 1995-96, el equipo, de nuevo bajo la dirección de Hovhannisyan, completó toda la campaña sin perder, estableciendo una racha récord de 59 partidos consecutivos sin conocer la derrota. Un año después, el Pyunik se convirtió en el primer club de la Armenia independiente en ganar un partido en competición europea, al vencer 3-1 al finlandés HJK Helsinki.
Tras ser disuelto brevemente a finales de los años noventa, el Pyunik renació en 2001, ocupando la plaza en la liga del campeón de la división inferior, el FC Armenicum. Comenzó entonces la etapa más dominante en la historia del fútbol armenio: entre 2001 y 2010 el club conquistó diez campeonatos nacionales consecutivos, y en 2002 se convirtió en el primer club armenio en avanzar a la segunda ronda de la fase clasificatoria de la Liga de Campeones, eliminando al campeón finlandés Tampere United por un global de 6-0.
En total, el Pyunik ha ganado 16 campeonatos armenios, 8 Copas de Armenia y 10 Supercopas del país, lo que lo convierte en el líder indiscutible de la clasificación histórica. Conocido por su afición como Nrnagoynner ("Colores de la Granada") por su equipación roja y blanca, en referencia a una fruta de gran importancia simbólica en la cultura armenia, el equipo disputa sus partidos como local en el Estadio Republicano Vazgen Sargsyan de Ereván. El club representa habitualmente a Armenia en competiciones europeas y cuenta con una de las academias juveniles más respetadas del país, que aporta talento de forma constante a la selección nacional.