El Pafos FC es uno de los proyectos futbolísticos de desarrollo más acelerado en Europa durante la última década: un club que en menos de diez años pasó de la segunda división chipriota a la fase de liga de la Champions League. Fue fundado el 10 de junio de 2014 mediante la fusión de los clubes locales AEP Paphos y AEK Kouklia, comenzando en la segunda categoría y alternando ascensos y descensos durante sus primeras temporadas.
El punto de inflexión llegó en 2017, cuando el control del club pasó al grupo inversor extranjero Total Sports Investments, propiedad de un empresario ruso y dirigido por un gestor británico. Las grandes inversiones en infraestructura de entrenamiento y un enfoque moderno en el fichaje de jugadores de todo el mundo transformaron rápidamente al equipo.
El primer gran título llegó en 2024, cuando el Pafos ganó sorprendentemente la Copa de Chipre, venciendo 3-0 en la final a Omonia Nicosia gracias a los goles de Muamer Tanković, Vlad Dragomir y Pedro Rodrigues - su primer gran logro histórico y su billete a las competiciones europeas. Un hito aún mayor llegó en la temporada 2024-25, cuando el Pafos, que ocho años antes militaba en segunda división, conquistó por primera vez en su historia el título de liga chipriota.
El campeonato le abrió las puertas a la fase previa de la Champions League, donde el Pafos venció sucesivamente al Maccabi Tel Aviv y al Dinamo Chișinău, y posteriormente se impuso en la eliminatoria de acceso frente al Estrella Roja de Belgrado, alcanzando por primera vez la fase de liga de la competición de clubes más prestigiosa de Europa - un logro sin precedentes para el fútbol chipriota.
El pilar del equipo en los últimos años fue el delantero sueco Muamer Tanković, formado en la cantera del Fulham, donde llegó a jugar en la Premier League siendo adolescente, y que permaneció en el Pafos hasta 2025, cuando fichó por el rival local, el Omonia. Actualmente, el eje del ataque es el brasileño Jajá, incorporado de forma permanente en el verano de 2025.
Debido a que el estadio propio del club, el Stelios Kyriakides Stadium de Pafos, no cumple los estándares de la UEFA para competiciones europeas, el equipo disputa sus partidos internacionales como local en el Alphamega Stadium de Limassol. Pese a carecer de la tradición multigeneracional de sus rivales de Nicosia o Limassol, el Pafos ha demostrado que el capital moderno combinado con una visión deportiva precisa puede construir una nueva potencia del fútbol mediterráneo en menos de una década.