Pogoń Szczecin to klub, którego historia jest nierozerwalnie związana ze Szczecinem i portowym charakterem miasta. Współczesna Pogoń została założona 21 kwietnia 1948 roku jako KS Sztorm, a jej pierwszymi sekcjami były piłka nożna i boks. W kolejnych latach klub przechodził zmiany organizacyjne i nazewnicze. W 1950 roku powstał KS Kolejarz Szczecin, a jesienią 1955 roku przyjął nazwę Pogoń, nawiązującą do tradycji przedwojennej Pogoni Lwów. W 1958 roku szczecinianie po raz pierwszy awansowali do najwyższej klasy rozgrywkowej, rozpoczynając długą obecność w krajowej elicie.
Jedną z najważniejszych postaci w pierwszych dekadach historii klubu był Florian Krygier. To właśnie z jego działalnością związany jest rozwój Pogoni w latach 50. i późniejszych, a także konsekwentne stawianie na szkolenie młodzieży. W 1957 roku prowadzony przez niego zespół wywalczył awans na zaplecze ekstraklasy, a rok później zdobył promocję do pierwszej ligi. Krygier przez lata pozostawał symbolem pracy organizacyjnej i szkoleniowej w Szczecinie. Jego imię nosi dziś stadion Pogoni.
Pierwszy znaczący sukces ligowy przyszedł w 1984 roku, gdy Pogoń Szczecin zdobyła brązowy medal mistrzostw Polski. Był to pierwszy medal w historii klubu. Trzy lata później Portowcy osiągnęli najlepszy wówczas wynik ligowy, kończąc sezon 1986/87 na drugim miejscu. Powtórzyli ten rezultat w sezonie 2000/01. Pogoń nigdy nie zdobyła mistrzostwa Polski, ale dwukrotne wicemistrzostwo oraz kilka innych wysokich pozycji sprawiły, że przez lata należała do czołowych zespołów polskiej ligi.
Klub czterokrotnie docierał do finału Pucharu Polski przed 2025 rokiem – w 1981, 1982, 2010 i 2024 roku – lecz za każdym razem przegrywał decydujące spotkanie. Szczególnie bolesny był finał z 2024 roku. Pogoń prowadziła z Wisłą Kraków 1:0 po golu Efthymisa Koulourisa, ale w dogrywce straciła dwie bramki i przegrała 1:2. W 2025 roku szczecinianie ponownie awansowali do finału, tym razem mierząc się z Legią Warszawa. Spotkanie zakończyło się wynikiem 3:4, co oznaczało kolejną porażkę w decydującym meczu. W efekcie Pogoń pozostaje bez zwycięstwa zarówno w mistrzostwach Polski, jak i w Pucharze Polski.
Europejska historia Portowców sięga 1965 roku, gdy klub zadebiutował w Pucharze Intertoto. Pogoń pokonała wówczas u siebie NK Zagrzeb 3:0. Pierwszy oficjalny występ w europejskich pucharach UEFA przypadł natomiast na sezon 1984/85, kiedy szczecinianie zmierzyli się z 1. FC Köln w pierwszej rundzie Pucharu UEFA. Niemiecki zespół wygrał oba spotkania, ale sam dwumecz był ważnym wydarzeniem w historii klubu i pierwszą konfrontacją Pogoni z rywalem tej rangi na europejskiej scenie.
W XXI wieku Pogoń powróciła do regularnych występów w europejskich kwalifikacjach. W sezonie 2021/22 zadebiutowała w Lidze Konferencji UEFA, a w kolejnych latach ponownie uczestniczyła w kwalifikacjach tego turnieju. W sezonie 2023/24 dotarła do trzeciej rundy kwalifikacyjnej, eliminując wcześniej Linfield FC, zanim odpadła z belgijskim KAA Gent. Europejskie występy stały się ważnym elementem współczesnej tożsamości klubu, choć Pogoń nie zdołała jeszcze awansować do głównej fazy europejskiego pucharu.
Tożsamość Pogoni jest mocno związana ze Szczecinem. Klub występuje w granatowo-bordowych barwach, a przydomek Portowcy nawiązuje bezpośrednio do portowego charakteru miasta. W herbie znajduje się gryf, jeden z najważniejszych symboli Szczecina i Pomorza Zachodniego. Domowe mecze zespół rozgrywa na Stadionie Miejskim im. Floriana Krygiera, przy ulicy Twardowskiego. Obiekt jest również ważnym elementem infrastruktury szkoleniowej klubu.
W historii Pogoni szczególne znaczenie ma praca z młodzieżą. Klub przez dekady rozwijał własne struktury szkoleniowe, a jednym z najważniejszych patronów tej filozofii pozostaje Florian Krygier. Wśród zawodników związanych z Pogonią znalazł się także Kamil Grosicki, wychowanek klubu i późniejszy reprezentant Polski, który stał się jedną z najbardziej rozpoznawalnych postaci współczesnej historii szczecińskiego zespołu. Pogoń pozostaje jednym z najważniejszych klubów Pomorza Zachodniego, a jej historia łączy silną lokalną tożsamość, tradycję szkolenia oraz wieloletnią obecność w najwyższej klasie rozgrywkowej.