«Паневежис» — один из самых молодых клубов, становившихся чемпионами Литвы, сумевший за короткий срок войти в число ведущих команд страны. Клуб был основан 18 февраля 2015 года и начал выступления во втором дивизионе. В 2018 году он выиграл Первый дивизион и получил право выступать в высшей лиге. С 2019 года команда постоянно играет в высшем дивизионе литовского футбола.
Главного успеха в своей истории «Паневежис» добился в 2023 году, впервые став чемпионом Литвы. Команда обеспечила себе титул за четыре тура до окончания чемпионата. До этого клуб уже выигрывал Кубок Литвы в 2020 году и Суперкубок страны в 2021 году. В 2024 году «Паневежис» вновь завоевал Суперкубок, а в 2025 году во второй раз выиграл национальный кубок.
Чемпионство 2023 года позволило клубу принять участие в наиболее престижной европейской кампании. В сезоне 2024/25 «Паневежис» дебютировал в квалификации Лиги чемпионов, где встретился с «Ягеллонией» из Белостока. Литовский чемпион проиграл оба матча и выбыл во втором отборочном раунде, после чего продолжил выступления в квалификации Лиги Европы и Лиги конференций. Ранее, в 2023 году, клуб также провёл заметное противостояние с израильским «Хапоэлем Беэр-Шева», которому уступил 1:2 по сумме двух матчей во втором квалификационном раунде Лиги конференций.
Домашние матчи клуб проводит на стадионе «Аукштайтия» в Паневежисе. Традиционные цвета «Паневежиса» — красный и белый. Несмотря на короткую историю, клуб быстро прошёл путь от второго дивизиона до чемпионства Литвы и участия в европейских квалификациях, став одним из заметных представителей современного литовского футбола.