Pocos clubes rumanos están tan estrechamente vinculados a la identidad universitaria de su ciudad como Universitatea Cluj. Los orígenes del club se remontan a 1919, cuando la organización deportiva de la sociedad estudiantil rumana «Petru Maior» se trasladó a Cluj junto con la propia organización. Desde sus primeros años, el club estuvo ligado al ambiente universitario, mientras que sus tradicionales colores blanco y negro se convirtieron en uno de los principales elementos de su identidad.
El capítulo más importante de la historia de Universitatea Cluj está relacionado con la Copa de Rumanía. El club disputó la final de la primera edición del torneo en 1934 y, en total, ha alcanzado seis veces el partido decisivo. Su único triunfo llegó en 1965. En la final disputada en el Stadionul Republicii de Bucarest, el equipo, entonces denominado Știința Cluj, derrotó por 2-1 al Dinamo Pitești. Remus Câmpeanu y Zoltan Ivansuc marcaron los goles, mientras que en el equipo campeón también estaban jugadores como Mihai Adam y Simion Moguț.
El triunfo de 1965 permitió a Universitatea Cluj debutar en las competiciones europeas. En la Recopa de Europa 1965/66, el conjunto rumano superó al Wiener Neustädter austríaco en la primera ronda, con dos victorias: 1-0 como visitante y 2-0 en Cluj. En la siguiente eliminatoria se enfrentó al Atlético de Madrid. El equipo español ganó los dos partidos, 2-0 en Cluj y 4-0 en Madrid.
La segunda participación europea llegó en la Copa de la UEFA 1972/73. Universitatea Cluj comenzó con una contundente victoria por 4-1 ante el Levski de Sofía, pero el conjunto búlgaro remontó la eliminatoria en el partido de vuelta, imponiéndose por 5-1 después de la prórroga. El club también participó en la Copa Intertoto de 1995, aunque terminó último de su grupo.
En el ámbito nacional, Universitatea Cluj no posee un palmarés comparable al de los clubes rumanos más laureados. Su importancia se basa principalmente en su larga tradición, su vínculo con Cluj y su histórica relación con el mundo universitario. Entre las figuras más destacadas de su historia se encuentran Mihai Adam, Remus Câmpeanu y Mircea Luca. Este último se convirtió en uno de los grandes símbolos de la institución y su figura ha sido homenajeada junto al estadio.
En la actualidad, Universitatea Cluj disputa sus partidos como local en el Cluj Arena, situado cerca del antiguo estadio «Ion Moina». El club regresó a las competiciones europeas después de más de cinco décadas al clasificarse para la UEFA Conference League en 2025. Fue un momento importante para una institución cuya anterior participación europea se remontaba a la temporada 1972/73.
La historia de Universitatea Cluj es, por tanto, principalmente una historia de tradición, identidad local y estrecha relación con la vida universitaria. Un solo título de Copa de Rumanía no refleja por completo la importancia histórica del club: disputó la primera final de la competición en 1934 y ha alcanzado seis veces el partido decisivo. Su regreso al fútbol europeo después de 53 años demostró además que la tradición blanquinegra continúa siendo una parte importante de la identidad del club moderno.