Аугсбург «Аугсбург» был основан 8 августа 1907 года под названием Fußball-Klub Alemannia Augsburg. На протяжении большей части своей более чем столетней истории клуб оставался в тени немецкого футбола, несколько раз меняя название и переживая тяжёлый период на рубеже XX и XXI веков, когда из-за финансовых проблем опустился вплоть до четвёртого дивизиона. Свой нынешний облик клуб принял в 1969 году, объединившись со вторым крупным клубом города — TSV Schwaben Augsburg, в результате чего родился «Аугсбург» в его современном виде.
Настоящий перелом в истории клуба произошёл 8 мая 2011 года, когда победный гол Штефана Хайна на 85-й минуте матча против «Франкфурта» обеспечил «Аугсбургу» первый в истории выход в Бундеслигу. С тех пор клуб непрерывно выступает в высшем дивизионе — достижение само по себе значительное, учитывая существенно более скромные финансовые ресурсы по сравнению с ведущими клубами Германии.
Самым памятным сезоном в истории клуба стал 2015/16 год, когда «Аугсбург» занял рекордное для себя пятое место в таблице Бундеслиги, обеспечив тем самым исторический дебют в еврокубках. В групповом этапе Лиги Европы команда одержала решающую победу в Белграде, выйдя в плей-офф, где в раунде 1/16 финала встретилась с «Ливерпулем» и выбыла из турнира, уступив по сумме двух матчей с минимальным счётом (0:1).
Будучи крупнейшим футбольным клубом региона Швабия, «Аугсбург» представляет Баварию на футбольной карте Германии наряду с гораздо более состоятельным мюнхенским «Баварией», против которого проводит баварское дерби. Команду, прозванную Фуггерштедтер в честь знаменитой аугсбургской банкирской династии Фуггеров, принимает домашний стадион «ВВК Арена», используемый клубом с 2009 года.