Bayern Monachium to symbol dominacji, ale też klub o wyjątkowo złożonej tożsamości. Najlepiej oddaje ją hasło Mia san Mia – „Jesteśmy, jacy jesteśmy”. To nie tylko marketingowy slogan, lecz wyraz dumy, pewności siebie i mentalności zwycięzców, która każe podnosić się po każdej porażce.
Klub powstał 27 lutego 1900 roku w Monachium, gdy grupa piłkarzy oderwała się od gimnastycznego stowarzyszenia MTV 1879 München po tym, jak jego władze odmówiły zgody na przystąpienie sekcji piłkarskiej do Niemieckiego Związku Piłki Nożnej. Nowo powstały klub przyjął pierwotnie barwy biało-niebieskie, a dopiero w 1906 roku, po powiązaniu z Münchner Sport Club, zmienił je na czerwień i biel, które noszą piłkarze Bayernu do dziś.
Najmroczniejszy rozdział w historii klubu przypada na czasy III Rzeszy. W 1932 roku Bayern zdobył swoje pierwsze mistrzostwo Niemiec pod wodzą prezesa Kurta Landauera i trenera Richarda „Dombiego” Kohna, obu pochodzenia żydowskiego. Po dojściu Hitlera do władzy Landauer musiał zrezygnować z funkcji w 1933 roku, a w listopadzie 1938 roku, dzień po „nocy kryształowej”, trafił do obozu koncentracyjnego w Dachau. Dzięki wcześniejszej służbie wojskowej został zwolniony po 33 dniach i w 1939 roku wyemigrował do Szwajcarii, gdzie przetrwał wojnę.
Po jej zakończeniu Landauer wrócił do Monachium i w 1947 roku ponownie objął prezesurę klubu, przyczyniając się do jego odbudowy. Prawdziwa sportowa potęga przyszła jednak w latach 70., gdy pokolenie Franza Beckenbauera, Gerda Müllera i Seppa Maiera poprowadziło Bayern do trzech kolejnych triumfów w Pucharze Europy – w 1974, 1975 i 1976 roku – co do dziś pozostaje rzadkim osiągnięciem w historii tych rozgrywek.
Współcześnie Bayern jest jednym z najbardziej utytułowanych klubów świata. W XXI wieku dwukrotnie sięgnął po potrójną koronę – w 2013 i 2020 roku – a w latach 2013–2023 zdobywał mistrzostwo Niemiec jedenaście razy z rzędu, ustanawiając rekord wśród lig czołowej piątki Europy.